More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  58.61 
 
 		 587 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  59.08 
 
 		 556 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  100 
 
 		 554 aa  1105    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  27.85 
 
 		 474 aa  134  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  24.78 
 
 		 500 aa  126  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  26.72 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  24.72 
 
 		 674 aa  101  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  23.4 
 
 		 709 aa  101  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  25.55 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  25.55 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  25.55 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  23.62 
 
 		 668 aa  95.1  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  22.94 
 
 		 668 aa  94.7  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  24.79 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  20.98 
 
 		 699 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  23.76 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  23.65 
 
 		 679 aa  91.3  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.58 
 
 		 476 aa  90.9  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.53 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  24.09 
 
 		 724 aa  88.6  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  24.42 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.42 
 
 		 483 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  26.32 
 
 		 477 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  24.31 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  24.31 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  24.31 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  24.31 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  24.31 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  24.72 
 
 		 478 aa  87.4  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  24.31 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  24.31 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  23.74 
 
 		 483 aa  87.4  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.79 
 
 		 487 aa  87  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  24.11 
 
 		 643 aa  87  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  24.72 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  24.72 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  24.5 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  24.5 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  21.84 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  23.84 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  25.19 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  26.55 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  25.76 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  24.5 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  24.03 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.95 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  24.94 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  24.94 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.82 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  22.89 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  24.73 
 
 		 483 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.56 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  22.67 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  22.2 
 
 		 692 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  24.52 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  23.5 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  24.85 
 
 		 693 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  25.27 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  20.75 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.96 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  20.33 
 
 		 659 aa  73.9  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.99 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.48 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  21.96 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1334  sodium/proline symporter  25.62 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.56 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.56 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.56 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.56 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  26.11 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.56 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.91 
 
 		 487 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.59 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  23.93 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.48 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.56 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.53 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.53 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.48 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  24.35 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.51 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.91 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  26.21 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  25.62 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.54 
 
 		 498 aa  67  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.51 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  29.15 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.49 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  24.42 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  29.15 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  22.57 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>