105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28840  methyltransferase family protein  100 
 
 		 256 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13353  methyltransferase  50 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.356592  normal  0.242787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  51.13 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  39.1 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  36.14 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  27.92 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  37.12 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  36.5 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  32.72 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  38.46 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  36.69 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  37.88 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  23.97 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 202 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  28.12 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2956  methyltransferase type 12  33.51 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  31.48 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  37.04 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  36.44 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  27.08 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  23.65 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 209 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.73 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  25.54 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  32.82 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  31.49 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  37.84 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  44.55 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  44.55 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  44.55 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  26.29 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.18 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5471  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  0.745032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  28.18 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4877  methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  37.69 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4966  methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5245  methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  31.18 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  21.83 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.68 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  32.76 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  35.96 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.84 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  34.62 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2219  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  26.11 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  32.43 
 
 		 382 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  27.34 
 
 		 190 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  30.94 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  34.72 
 
 		 201 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 204 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>