More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26070 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26070  vanillate demethylase subunit B  100 
 
 		 314 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2825  ferredoxin  54.43 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0703333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.46 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1367  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.62 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7104  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.39 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3385  oxidoreductase FAD-binding region  44.64 
 
 		 329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00882636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4141  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.69 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.482707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1906  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.03 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2186  putative oxydoreductase  43.23 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  42.46 
 
 		 784 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.6 
 
 		 788 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  37.46 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.39 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  38.54 
 
 		 780 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.32 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  35.53 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.62 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  38.03 
 
 		 782 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  37.13 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  38.06 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  37.38 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  37.18 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  38.81 
 
 		 783 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  39.16 
 
 		 784 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  39.16 
 
 		 784 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  39.16 
 
 		 784 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  39.16 
 
 		 784 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  38.81 
 
 		 784 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  38.81 
 
 		 784 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  38.46 
 
 		 784 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  38.46 
 
 		 775 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  34.86 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  37.76 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  37.76 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  36.21 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  38.36 
 
 		 774 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  36.62 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  36.62 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  38.03 
 
 		 788 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  35.89 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  35.92 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.36 
 
 		 783 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  37.8 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  35.71 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.76 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  35.27 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  34.41 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  34.4 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  33.33 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  36.59 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  34.28 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  34.28 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  38.81 
 
 		 794 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  34.28 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.05 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  33.92 
 
 		 588 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  34.04 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  37.67 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  36.79 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  34.41 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  36.17 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  35.56 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  38.01 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  36.4 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  35.44 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  35.46 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.15 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.92 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  37.67 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  34.04 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  36.61 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  34.83 
 
 		 328 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  34.8 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  35.69 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  31.53 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  37.88 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  35.44 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  33.92 
 
 		 323 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  36.99 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.76 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  36.68 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0337  ferredoxin  37.24 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  36.46 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  34.04 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  33.1 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  36.49 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  34.36 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  33.44 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  34.97 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  32.14 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  34.62 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  34.62 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.74 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.22 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  34.8 
 
 		 769 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  34.29 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  34.41 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  34.15 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  35.89 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5381  ferredoxin  35.64 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>