280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0788 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  100 
 
 
408 aa  813    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0480  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0644  Peptidase M23  34.06 
 
 
408 aa  236  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0503  transaldolase  33.99 
 
 
405 aa  231  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1215  M24/M37 family peptidase  34.51 
 
 
388 aa  227  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  32.19 
 
 
397 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0614  peptidase, M23/M37 family  33.25 
 
 
391 aa  208  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  32.19 
 
 
397 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  31.93 
 
 
397 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 
435 aa  206  5e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  24.68 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  22.98 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.12 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.37 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.14 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  25.09 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.63 
 
 
397 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  33.7 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  30.17 
 
 
610 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.77 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  27.59 
 
 
605 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  28.45 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  32.74 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  30.58 
 
 
449 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  32.59 
 
 
309 aa  60.1  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  30 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  29.46 
 
 
288 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  25 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  20.79 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  22.74 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  27.12 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  23.87 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  33.91 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32 
 
 
314 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  29.13 
 
 
475 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.31 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  32 
 
 
372 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  31.31 
 
 
377 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  24.05 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  28.8 
 
 
430 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  26.98 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  32.53 
 
 
484 aa  56.6  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  24.55 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  27.83 
 
 
372 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  23.56 
 
 
436 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  27.27 
 
 
446 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.74 
 
 
455 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  26.36 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  27.4 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  26.89 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  27.83 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  29.41 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  24.21 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  25.07 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  26.32 
 
 
345 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  29.75 
 
 
509 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  26.32 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.36 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  29.75 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  29 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  27.33 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  25.66 
 
 
454 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  28.1 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  29.85 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  31.63 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  26.02 
 
 
453 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  31.2 
 
 
282 aa  53.1  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  28.35 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  27.69 
 
 
274 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  27.27 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  28.7 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  29.57 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  34.88 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  28.37 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  26.26 
 
 
438 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  26.32 
 
 
400 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  29.46 
 
 
308 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  25.87 
 
 
447 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  28.5 
 
 
503 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  30.21 
 
 
244 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  33.33 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  32.97 
 
 
434 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  25.87 
 
 
447 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  24.16 
 
 
399 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  29.25 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.33 
 
 
312 aa  51.6  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  27.56 
 
 
464 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  25.83 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  35.96 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  30.43 
 
 
453 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  29.91 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  29.55 
 
 
288 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  33.03 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  24.42 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  28.42 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  35.96 
 
 
427 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  34.83 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  30.23 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  30.23 
 
 
453 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  35.96 
 
 
427 aa  50.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>