94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0585 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0585  heptosyltransferase-like protein  100 
 
 
322 aa  657    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000371878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0263  glycosyl transferase family 9  72.56 
 
 
320 aa  488  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.951367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.53 
 
 
345 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0327  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
339 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0012  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
356 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0568378  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
340 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3928  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  25.3 
 
 
333 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3693  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  26.73 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  23.51 
 
 
779 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2559  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5595  glycosyl transferase family 9  22.97 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421623  normal  0.389921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.08 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  24.91 
 
 
327 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  24.16 
 
 
367 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0899  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.63 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  22.74 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  21.94 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  22.87 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  25.4 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.62 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  22.68 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  21.36 
 
 
381 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0561  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  22.19 
 
 
372 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  23.45 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.64 
 
 
516 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.8 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
347 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  20.71 
 
 
405 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.21 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.8 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.8 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
400 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.95 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.9 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  20.82 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11250  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  23.1 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.706344  normal  0.204518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.84 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  20.88 
 
 
354 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  18.77 
 
 
401 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.12 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
379 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  21.39 
 
 
348 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  37.23 
 
 
367 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  34.48 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  20.68 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  35.29 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  19.16 
 
 
401 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.65 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  19.16 
 
 
401 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.1 
 
 
360 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.63 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  20 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  23.81 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.34 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  21.84 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  21.84 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.08 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3375  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  26.32 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  22.11 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.43 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  29 
 
 
458 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1407  glycosyl transferase family protein  20.45 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.86 
 
 
353 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  20.63 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.89 
 
 
354 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.89 
 
 
354 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.87 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.87 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.87 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.68 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  22.76 
 
 
341 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  23.57 
 
 
329 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5747  heptosyltransferase II  21.5 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.87 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
340 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.55 
 
 
354 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.68 
 
 
390 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
392 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.38 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  21.5 
 
 
345 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.38 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.43 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  27.68 
 
 
394 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  30.23 
 
 
392 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  22.46 
 
 
337 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>