149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3828 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3828  phosphatidylserine decarboxylase related protein  100 
 
 
417 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458299  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4218  phosphatidylserine decarboxylase related protein  86.84 
 
 
418 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6313  Phosphatidylserine decarboxylase  56.52 
 
 
404 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  41.75 
 
 
220 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  45.18 
 
 
214 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  45.29 
 
 
218 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  46.33 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.39 
 
 
205 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  39.19 
 
 
232 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  43.79 
 
 
219 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4178  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.62 
 
 
229 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  39.34 
 
 
214 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  41.76 
 
 
219 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  42.31 
 
 
219 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  37.69 
 
 
217 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  39.88 
 
 
224 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  41.11 
 
 
208 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  41.53 
 
 
232 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  42.78 
 
 
232 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  42.31 
 
 
217 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  41.76 
 
 
194 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.39 
 
 
232 aa  126  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  41.53 
 
 
232 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  36.74 
 
 
213 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  39.09 
 
 
218 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.46 
 
 
221 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.46 
 
 
221 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  44.32 
 
 
232 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3717  phosphatidylserine decarboxylase  43.83 
 
 
213 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00382056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
214 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
214 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  39.07 
 
 
213 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
214 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
214 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
214 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  44.71 
 
 
218 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
214 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
214 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  38.04 
 
 
230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  41.99 
 
 
215 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  41.4 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  46.78 
 
 
225 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  39.04 
 
 
231 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  45.51 
 
 
232 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  41.67 
 
 
215 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  44.07 
 
 
232 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  42.29 
 
 
232 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.59 
 
 
237 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.59 
 
 
237 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  41.34 
 
 
248 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
216 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
224 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
216 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
216 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
216 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
212 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
216 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  39.33 
 
 
221 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
216 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
216 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10442  phosphatidylserine decarboxylase  41.76 
 
 
231 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.664785  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  40.98 
 
 
232 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.08 
 
 
232 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  40.64 
 
 
247 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
212 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  37.64 
 
 
208 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  40.22 
 
 
257 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  40.88 
 
 
214 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  42.56 
 
 
217 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.85 
 
 
236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.85 
 
 
236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
215 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  41.14 
 
 
225 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
212 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
252 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.85 
 
 
236 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.3 
 
 
236 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  40.44 
 
 
232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  39.89 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0748  phosphatidylserine decarboxylase  41.46 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0895  phosphatidylserine decarboxylase  41.46 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  38.51 
 
 
232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  39.89 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  36.96 
 
 
212 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.02 
 
 
219 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.07 
 
 
218 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  34.91 
 
 
203 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  37.89 
 
 
208 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0288  phosphatidylserine decarboxylase-related  41.46 
 
 
212 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  39.81 
 
 
233 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  42.05 
 
 
226 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0116  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.41 
 
 
222 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000497171  hitchhiker  0.00000000948929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  36.75 
 
 
213 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40 
 
 
237 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  33.82 
 
 
212 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.95 
 
 
233 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  33.87 
 
 
226 aa  106  7e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.07 
 
 
225 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>