86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3570 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  88.51 
 
 		 383 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  69.25 
 
 		 389 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  66.49 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  69.17 
 
 		 386 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  66.58 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  64.51 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  64.6 
 
 		 372 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  63.64 
 
 		 377 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  51.32 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  44.77 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 		 484 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  31.7 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  32.74 
 
 		 443 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  30.5 
 
 		 435 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  32.65 
 
 		 422 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  29.49 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  31.44 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  31.45 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  30.26 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  29.37 
 
 		 445 aa  122  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  32.38 
 
 		 499 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  27.02 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  29.7 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  29.48 
 
 		 455 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  29.48 
 
 		 587 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  30.12 
 
 		 630 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  26.72 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  31.28 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  27.8 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  26.91 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  26.92 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 633 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  32.52 
 
 		 587 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  27.65 
 
 		 630 aa  53.9  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  27.36 
 
 		 663 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  28.29 
 
 		 638 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  23.17 
 
 		 593 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 		 639 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  46.67 
 
 		 697 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  24.88 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  29.85 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  28.57 
 
 		 681 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.56 
 
 		 593 aa  50.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.56 
 
 		 593 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  26.92 
 
 		 634 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  26.5 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  26.5 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  26.5 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  29.31 
 
 		 739 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  26.5 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  30 
 
 		 663 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  29.8 
 
 		 628 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  27.98 
 
 		 663 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  26.5 
 
 		 650 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  25.93 
 
 		 629 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 		 627 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  42.86 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  26.5 
 
 		 630 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  27.56 
 
 		 674 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  25.64 
 
 		 652 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  27.08 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  25.64 
 
 		 650 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  27.27 
 
 		 693 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  25.64 
 
 		 654 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  26.06 
 
 		 673 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  30.71 
 
 		 640 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  25.64 
 
 		 653 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  25.64 
 
 		 651 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  25.64 
 
 		 654 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  25.64 
 
 		 678 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  24.79 
 
 		 653 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  25.64 
 
 		 678 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  24.79 
 
 		 653 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  24.79 
 
 		 653 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  26.67 
 
 		 638 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  29.57 
 
 		 628 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  24.79 
 
 		 653 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 		 658 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  30.41 
 
 		 669 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  27.91 
 
 		 715 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  27.91 
 
 		 632 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  35.71 
 
 		 583 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  25.17 
 
 		 625 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  26.67 
 
 		 651 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>