More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0249 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0249  ABC transporter related  100 
 
 		 336 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  57.41 
 
 		 346 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.89 
 
 		 341 aa  298  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  56.42 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  50.48 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.55 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.18 
 
 		 301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.71 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  41.94 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.55 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  45.7 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  38.49 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  44.52 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  45.1 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  40.82 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  42.32 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  41.75 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  40.07 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.74 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  41.1 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  44.56 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  46.44 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  39.67 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  41.56 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  35.26 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  40.46 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 305 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.68 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  36.66 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.28 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  38.28 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  38.28 
 
 		 303 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  38.28 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  38.49 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  38.14 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  42.16 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.29 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  41.85 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  36.31 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  36.9 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  45.88 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  40.92 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  46.21 
 
 		 897 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  41.67 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  47.9 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  37 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  35.13 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  37.3 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  46.86 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  40.26 
 
 		 968 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  51.2 
 
 		 258 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  41.48 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  41.37 
 
 		 409 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  46.72 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  51.18 
 
 		 242 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.16 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  35.1 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.84 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  41.29 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  45.64 
 
 		 866 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 242 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.58 
 
 		 300 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  39.86 
 
 		 322 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.69 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  44.03 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>