More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3015 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3015  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 398 aa  785    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00421083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.23 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  41.01 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  43.99 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  45.08 
 
 		 436 aa  292  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  46.26 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  45.25 
 
 		 436 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  48.59 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  44.75 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  48.59 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  45.45 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  44.62 
 
 		 444 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.78 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  45.28 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 		 447 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  47.14 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.56 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  41.13 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  44.38 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 		 443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  47.65 
 
 		 433 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  44.57 
 
 		 445 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 429 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  39.78 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 		 442 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  43.04 
 
 		 436 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  43.1 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  44.48 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  45.03 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 431 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 431 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  44.72 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 		 442 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 431 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 		 442 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 		 434 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  44.76 
 
 		 431 aa  275  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  41.85 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  41.85 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.11 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  40.9 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  44.31 
 
 		 431 aa  274  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 		 431 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.77 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  41.85 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  46.52 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 463 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 		 430 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  39.72 
 
 		 434 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  41.52 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  42.54 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  42.54 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  43.2 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  43.79 
 
 		 437 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  42.54 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  42.22 
 
 		 431 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  41.9 
 
 		 431 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  42.22 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  42.22 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  42.22 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  42.22 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  42.22 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  42.72 
 
 		 450 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 442 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>