More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2788 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 608 aa  1231    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  60.35 
 
 		 623 aa  734    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  60.13 
 
 		 608 aa  754    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  44.15 
 
 		 663 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  42.63 
 
 		 642 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 641 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  40.91 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  40.91 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.91 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.82 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  40.91 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  40.91 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.22 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.13 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.91 
 
 		 646 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.44 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 668 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 674 aa  424  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 650 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 663 aa  420  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 652 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 650 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 670 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 643 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 		 641 aa  403  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 		 640 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 		 640 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  36.12 
 
 		 670 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  36.02 
 
 		 650 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  36.17 
 
 		 660 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  35.85 
 
 		 650 aa  364  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  36.49 
 
 		 667 aa  361  2e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  34.68 
 
 		 659 aa  356  8.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  33.96 
 
 		 653 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  35.19 
 
 		 639 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  35.93 
 
 		 666 aa  355  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  35.4 
 
 		 660 aa  353  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  36 
 
 		 638 aa  351  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  35.87 
 
 		 638 aa  349  7e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  35.02 
 
 		 639 aa  349  7e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  35.56 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  33.76 
 
 		 661 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 656 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 664 aa  340  5.9999999999999996e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  33.28 
 
 		 656 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  34.05 
 
 		 664 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  34.05 
 
 		 664 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  33.97 
 
 		 656 aa  336  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  34.57 
 
 		 655 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 655 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0914  acetyl-CoA synthetase  33.18 
 
 		 653 aa  333  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  34.06 
 
 		 661 aa  333  8e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  32.3 
 
 		 649 aa  333  8e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  34.6 
 
 		 649 aa  332  9e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  33.28 
 
 		 649 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0685  acetyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 653 aa  332  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  33.8 
 
 		 648 aa  330  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  33.28 
 
 		 661 aa  329  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  33.44 
 
 		 629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  34.35 
 
 		 652 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  34.02 
 
 		 663 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  34.19 
 
 		 652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  33.55 
 
 		 667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  33.23 
 
 		 648 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  33.33 
 
 		 651 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  35.11 
 
 		 656 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  34.19 
 
 		 652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  34.15 
 
 		 651 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  33.6 
 
 		 631 aa  328  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  33.76 
 
 		 647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  33.44 
 
 		 631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  34.89 
 
 		 668 aa  327  5e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.08 
 
 		 655 aa  327  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 715 aa  326  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3260  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 653 aa  326  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  33.44 
 
 		 632 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  33.97 
 
 		 636 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  34.18 
 
 		 644 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  33.44 
 
 		 632 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  32.72 
 
 		 682 aa  326  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  33.22 
 
 		 658 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002199  acetyl-coenzyme A synthetase  33.82 
 
 		 650 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 645 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2833  acetyl-CoA synthetase  32.59 
 
 		 649 aa  324  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  32.54 
 
 		 632 aa  323  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  33.5 
 
 		 652 aa  323  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  32.35 
 
 		 655 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  34.34 
 
 		 670 aa  322  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  34.76 
 
 		 666 aa  322  9.999999999999999e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  31.29 
 
 		 656 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  34.63 
 
 		 661 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  34.48 
 
 		 632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  35.03 
 
 		 648 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  31.85 
 
 		 648 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 656 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  34.37 
 
 		 650 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 650 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>