210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3220 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  65.54 
 
 		 769 aa  1056    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  100 
 
 		 768 aa  1585    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2914  penicillin amidase  62.37 
 
 		 770 aa  966    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  56.24 
 
 		 768 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02441  putative hydrolase  46.25 
 
 		 776 aa  703    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2669  penicillin amidase  58.62 
 
 		 782 aa  934    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1223  penicillin amidase family protein  35.71 
 
 		 810 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  36.04 
 
 		 804 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0780  peptidase  37.01 
 
 		 796 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  37.11 
 
 		 886 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  37.01 
 
 		 796 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1282  peptidase S45 penicillin amidase  36.47 
 
 		 775 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224327  normal  0.39054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  37.36 
 
 		 831 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  36.88 
 
 		 797 aa  465  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1038  penicillin amidase, putative  36.84 
 
 		 783 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2163  peptidase  36.82 
 
 		 815 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.703029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1484  putative penicillin amidase  36.84 
 
 		 790 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0153  putative penicillin amidase  36.84 
 
 		 790 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1011  putative penicillin amidase  36.84 
 
 		 790 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  36.35 
 
 		 829 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2008  putative penicillin amidase  36.56 
 
 		 790 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2028  putative penicillin amidase  36.69 
 
 		 790 aa  459  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01150  penicillin acylase II  35.51 
 
 		 805 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1765  peptidase S45 penicillin amidase  33.93 
 
 		 777 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3735  penicillin amidase  34.34 
 
 		 758 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  32.36 
 
 		 786 aa  361  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  24.56 
 
 		 822 aa  227  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  26.67 
 
 		 796 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  26.05 
 
 		 796 aa  221  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.09 
 
 		 796 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.44 
 
 		 796 aa  220  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.3 
 
 		 796 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.3 
 
 		 796 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.37 
 
 		 796 aa  220  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  26.41 
 
 		 796 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.93 
 
 		 796 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.33 
 
 		 796 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  27.25 
 
 		 819 aa  207  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.86 
 
 		 821 aa  204  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  26.26 
 
 		 804 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  27.47 
 
 		 829 aa  202  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.95 
 
 		 770 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.56 
 
 		 769 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  27.36 
 
 		 854 aa  198  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  28.45 
 
 		 803 aa  198  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  26.13 
 
 		 823 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  25.78 
 
 		 827 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  26.07 
 
 		 817 aa  194  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  27.79 
 
 		 855 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  25.9 
 
 		 843 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  26.25 
 
 		 827 aa  191  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  25.49 
 
 		 819 aa  190  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  25 
 
 		 813 aa  190  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  25.39 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  27.51 
 
 		 858 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.28 
 
 		 818 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  25.9 
 
 		 833 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4913  peptidase S45 penicillin amidase  26.34 
 
 		 740 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0991334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  26.98 
 
 		 789 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  28.66 
 
 		 854 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  25.87 
 
 		 821 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  27.02 
 
 		 698 aa  180  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  25.66 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  25.42 
 
 		 774 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  25.03 
 
 		 823 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  24.2 
 
 		 779 aa  178  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  25 
 
 		 870 aa  177  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  26.41 
 
 		 810 aa  177  8e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  26.91 
 
 		 856 aa  177  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  24.91 
 
 		 823 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  26.93 
 
 		 809 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.36 
 
 		 809 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  25.43 
 
 		 806 aa  174  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  26.79 
 
 		 787 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  27.8 
 
 		 818 aa  171  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  30.53 
 
 		 821 aa  171  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  25.71 
 
 		 857 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  25.77 
 
 		 889 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.87 
 
 		 808 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  27.64 
 
 		 872 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.86 
 
 		 780 aa  164  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  24.8 
 
 		 693 aa  161  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25.73 
 
 		 903 aa  161  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.36 
 
 		 864 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  25.84 
 
 		 792 aa  157  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  23.96 
 
 		 788 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  28.35 
 
 		 821 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  23.8 
 
 		 844 aa  155  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.68 
 
 		 795 aa  154  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  24.65 
 
 		 809 aa  150  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  25.59 
 
 		 774 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  24.54 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  24.87 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  25.25 
 
 		 787 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  24.18 
 
 		 829 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.68 
 
 		 811 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  24.58 
 
 		 787 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  23.21 
 
 		 826 aa  149  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  24.25 
 
 		 847 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  25.19 
 
 		 803 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>