62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0462 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  80.4 
 
 		 250 aa  434  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  79.2 
 
 		 251 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  77.2 
 
 		 250 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  72 
 
 		 250 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  71.6 
 
 		 250 aa  390  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  72 
 
 		 250 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  71.2 
 
 		 250 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  70.8 
 
 		 250 aa  387  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  69.6 
 
 		 250 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  70.4 
 
 		 250 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  68.8 
 
 		 250 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  69.2 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  69.2 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  67.2 
 
 		 250 aa  362  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  70.21 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  49.42 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  48.25 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  47.08 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  47.1 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  47.08 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  45.35 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  45.35 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  46.03 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  45.31 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  44.9 
 
 		 261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  43.25 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  43.9 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  43.5 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  43.5 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  43.27 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  41.09 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  39.39 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  34.4 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.55 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  34.15 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  35.47 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  29.84 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  31.78 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  29.13 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  30.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  22.31 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  31.4 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  29.81 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  29.81 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  24.88 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000282973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  24.91 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  28.82 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  23.68 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  26.91 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1228  hypothetical protein  29.7 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6604  hypothetical protein  29.7 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.156691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1215  outer membrane protein OmpK, putative  27.09 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  26.35 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000631711  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03287  hypothetical protein  27.98 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1001  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24.77 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000919402  n/a   
 
 
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  22.44 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1040  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.6 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000125932  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1036  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25 
 
 		 279 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000103481  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1101  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25 
 
 		 279 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000152935  unclonable  0.0000213544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0110  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.24 
 
 		 289 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>