288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0174 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  49.07 
 
 
665 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  74.77 
 
 
660 aa  1032    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  53.46 
 
 
645 aa  720    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  78.49 
 
 
656 aa  1083    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  75.98 
 
 
654 aa  1026    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  73.94 
 
 
654 aa  1009    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  54.22 
 
 
653 aa  714    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  75.51 
 
 
654 aa  1023    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  72.71 
 
 
682 aa  985    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  75.51 
 
 
654 aa  1018    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  53.26 
 
 
654 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  73.11 
 
 
646 aa  1001    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  76.96 
 
 
662 aa  1051    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  54.65 
 
 
657 aa  718    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  75.04 
 
 
654 aa  1009    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  74.61 
 
 
654 aa  1032    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  74.96 
 
 
654 aa  1031    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  72.24 
 
 
678 aa  992    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  53.98 
 
 
649 aa  737    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  100 
 
 
670 aa  1372    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  75.55 
 
 
654 aa  1026    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  47.66 
 
 
670 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  46.19 
 
 
663 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  43.8 
 
 
646 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  35.48 
 
 
646 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  39.56 
 
 
634 aa  398  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  32.95 
 
 
633 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  32.4 
 
 
633 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  31.86 
 
 
635 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  29.98 
 
 
633 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  29.88 
 
 
633 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  28.74 
 
 
640 aa  266  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  32.67 
 
 
649 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  31.45 
 
 
696 aa  260  5.0000000000000005e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  30.83 
 
 
647 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  33.27 
 
 
652 aa  256  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  30.29 
 
 
712 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  31.4 
 
 
712 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  27.11 
 
 
652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  31.04 
 
 
628 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  30.8 
 
 
656 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  29.06 
 
 
650 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  30.47 
 
 
666 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  29.25 
 
 
695 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  28.71 
 
 
700 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  31.24 
 
 
717 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  28.71 
 
 
700 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  28.27 
 
 
690 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  28.02 
 
 
685 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.74 
 
 
697 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  28.02 
 
 
685 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  28.02 
 
 
685 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  29.42 
 
 
633 aa  216  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  27.79 
 
 
695 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  29.26 
 
 
611 aa  200  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  27.94 
 
 
695 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  30.32 
 
 
550 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  26.92 
 
 
621 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  27.13 
 
 
597 aa  161  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  25.73 
 
 
643 aa  157  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26.23 
 
 
651 aa  136  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  24.39 
 
 
642 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  29.17 
 
 
643 aa  121  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  23.61 
 
 
645 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  29.24 
 
 
630 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  25.1 
 
 
677 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.75 
 
 
677 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  25.3 
 
 
666 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  26.71 
 
 
641 aa  107  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  24.38 
 
 
628 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  25.81 
 
 
630 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  23.33 
 
 
639 aa  98.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  22.2 
 
 
671 aa  97.8  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  26.41 
 
 
609 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  23.9 
 
 
628 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  23.9 
 
 
628 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.9 
 
 
628 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.9 
 
 
628 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  23.9 
 
 
628 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  23.9 
 
 
628 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.41 
 
 
730 aa  88.6  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.63 
 
 
628 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  26.25 
 
 
629 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  23.94 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  23.69 
 
 
639 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.9 
 
 
628 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  23.47 
 
 
639 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  23.44 
 
 
639 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  23.63 
 
 
628 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  23.44 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  23.44 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  23.44 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  23.35 
 
 
628 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.19 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  23.44 
 
 
639 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  25.55 
 
 
593 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  22.39 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  23.28 
 
 
733 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  24.21 
 
 
733 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2929  sulfatase  23.28 
 
 
733 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0161141  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>