48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8291 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  47.79 
 
 
354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  44.04 
 
 
361 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  46.59 
 
 
365 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  37.5 
 
 
392 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  40.91 
 
 
390 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  67.39 
 
 
518 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  39.51 
 
 
352 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  36.62 
 
 
369 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  44.27 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  53.96 
 
 
506 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  56.34 
 
 
520 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  34.95 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  31.18 
 
 
318 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  29.55 
 
 
321 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  30.28 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  30.29 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  29.5 
 
 
321 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  30.03 
 
 
290 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  28.49 
 
 
341 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  28.53 
 
 
319 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  28.07 
 
 
310 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  29.87 
 
 
328 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  30.49 
 
 
321 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  29.46 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  29 
 
 
293 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  31.73 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  27.41 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  28.57 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  26.44 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  26.4 
 
 
372 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  31.89 
 
 
220 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  25.99 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  29.44 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  27.43 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  26.89 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  27.53 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  25.98 
 
 
359 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  24.84 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  24.78 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  33.02 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  25.84 
 
 
297 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  24.82 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  25.93 
 
 
393 aa  53.1  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  33.77 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  34.62 
 
 
316 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  21.81 
 
 
301 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>