More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8249 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8249  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  100 
 
 
1501 aa  2889    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00620759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  45.88 
 
 
1908 aa  463  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  46.68 
 
 
1929 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  47.34 
 
 
1923 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  47.17 
 
 
1935 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  44.61 
 
 
1985 aa  440  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  51.33 
 
 
1934 aa  435  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.6 
 
 
1984 aa  437  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  47.22 
 
 
1951 aa  435  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2179  Beta-ketoacyl synthase  47.95 
 
 
1927 aa  428  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0632435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  40.28 
 
 
2888 aa  347  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  29.37 
 
 
3008 aa  251  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.81 
 
 
2300 aa  245  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  33.13 
 
 
1272 aa  244  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  34.48 
 
 
3115 aa  244  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  34.69 
 
 
3243 aa  244  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  31.24 
 
 
2327 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  37.81 
 
 
2560 aa  234  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  34.35 
 
 
2314 aa  232  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  33.94 
 
 
2772 aa  232  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  29.72 
 
 
2531 aa  230  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  29.27 
 
 
1764 aa  229  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  29.46 
 
 
2764 aa  228  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  28.34 
 
 
1772 aa  226  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.11 
 
 
2750 aa  226  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.89 
 
 
2661 aa  225  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  29.69 
 
 
2624 aa  222  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  31.89 
 
 
2664 aa  222  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.69 
 
 
2694 aa  221  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  29.69 
 
 
2693 aa  221  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  29.22 
 
 
2640 aa  221  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  34.98 
 
 
2189 aa  221  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  31.07 
 
 
2619 aa  220  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  29.38 
 
 
2657 aa  220  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  29.46 
 
 
2620 aa  219  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  28.91 
 
 
2703 aa  219  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  28.91 
 
 
2704 aa  219  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  31.69 
 
 
2642 aa  218  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  28.55 
 
 
2683 aa  218  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  36.48 
 
 
2386 aa  217  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  36.73 
 
 
2338 aa  217  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  34.08 
 
 
2298 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  35.05 
 
 
2628 aa  216  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  31.66 
 
 
2553 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  30.93 
 
 
2542 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.58 
 
 
2477 aa  207  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.58 
 
 
2443 aa  205  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 
1740 aa  201  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  32.17 
 
 
2503 aa  198  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  30.43 
 
 
1656 aa  197  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  32.85 
 
 
2448 aa  194  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  30.61 
 
 
2333 aa  194  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.57 
 
 
2771 aa  193  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
1480 aa  192  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.6 
 
 
2249 aa  191  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.06 
 
 
2414 aa  191  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1417  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.04 
 
 
1998 aa  191  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.58 
 
 
3099 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  31.62 
 
 
2674 aa  190  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  30.7 
 
 
1413 aa  190  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1451  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.76 
 
 
1989 aa  189  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  30.76 
 
 
2604 aa  189  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1423  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.08 
 
 
1987 aa  189  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1324  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.59 
 
 
1985 aa  189  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.818863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  32.76 
 
 
2816 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2931  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.02 
 
 
1981 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.318285  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  29.01 
 
 
2501 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  30.79 
 
 
1696 aa  185  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  29.55 
 
 
1939 aa  184  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  29.94 
 
 
5822 aa  184  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  29.94 
 
 
5778 aa  184  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  26.83 
 
 
2754 aa  184  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  29.94 
 
 
1749 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.75 
 
 
2284 aa  184  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  34.22 
 
 
1959 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 
1453 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  30.09 
 
 
3696 aa  182  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4042  Beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 
2036 aa  181  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3204  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaC  30.36 
 
 
1937 aa  180  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.47814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.92 
 
 
1845 aa  180  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  27.63 
 
 
4036 aa  179  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.06 
 
 
1822 aa  179  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  32.07 
 
 
2230 aa  178  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  29.57 
 
 
5915 aa  178  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  29.57 
 
 
1619 aa  178  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2629  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.12 
 
 
1979 aa  178  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4001  Beta-ketoacyl synthase  32.65 
 
 
2000 aa  178  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  33.4 
 
 
1631 aa  178  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  27 
 
 
3780 aa  177  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2735  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.04 
 
 
1976 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
2551 aa  177  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  29.18 
 
 
1208 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  34.48 
 
 
2266 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1599  beta keto-acyl synthase  30.06 
 
 
1963 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  33.94 
 
 
4649 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2668  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.61 
 
 
1981 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  29.73 
 
 
5993 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2842  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.55 
 
 
1989 aa  175  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  29.07 
 
 
3111 aa  174  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  32.94 
 
 
2880 aa  174  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>