122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6627 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  324  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  64.81 
 
 
166 aa  215  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  36.81 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  33.1 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  33.78 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  32.65 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  34.59 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  30.34 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  34.33 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  31.25 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  33.06 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  30.56 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  29.45 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  29.17 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  35.29 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  35.29 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  35.29 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  33.08 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  30.14 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  31.54 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  27.59 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  31.94 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  30.2 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  31.78 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  30.2 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  32.03 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  30.2 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  30.2 
 
 
134 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  32.03 
 
 
393 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  28.47 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  30.37 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  34.27 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  32.26 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  30.47 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  27.1 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  30 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  28.66 
 
 
319 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  28.91 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  28.12 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.2 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  31.47 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  31.47 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  26.62 
 
 
335 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  29.46 
 
 
157 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  29.33 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  34.85 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  30.2 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  29.23 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  28.47 
 
 
188 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.33 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1672  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  27.33 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1696  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1645  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817495  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5452  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080026  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5849  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0326756  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  28.46 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5645  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0531  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.426838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0552  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0634  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  26.45 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  27.91 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  27.03 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  33.61 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  25.35 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  27.63 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  25 
 
 
343 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  31.25 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  29.17 
 
 
322 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  31.25 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  25 
 
 
343 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  29.8 
 
 
317 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  37.18 
 
 
319 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4559  hypothetical protein  26.06 
 
 
412 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.02 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.02 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  25.56 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  26.47 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  36.67 
 
 
324 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  29.8 
 
 
317 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  38.71 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  33.98 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  31.85 
 
 
322 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  26.57 
 
 
352 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  31.85 
 
 
326 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  35 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  23.85 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  23.85 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  23.7 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>