More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6174 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  100 
 
 		 349 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  41.82 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0809  transcriptional regulator, LacI family  35.21 
 
 		 349 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  36.29 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4547  transcriptional regulator, LacI family  36.05 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2322  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131448  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3832  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0370934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4528  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3910  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4014  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27 
 
 		 335 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0637146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3954  regulatory protein LacI  27 
 
 		 335 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  26.1 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  28.15 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3845  transcriptional regulator, LacI-family  26.71 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587178  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3841  regulatory protein LacI  29.33 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  28.02 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  30.28 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  28.28 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  32.67 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  30.99 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  27.63 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  29.6 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.04 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  28.3 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.11 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  26.76 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  30.09 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  34 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  29.78 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.65 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  27.12 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  24.48 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  29.36 
 
 		 335 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  25.81 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  28.09 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  28.22 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  28 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  23.91 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  27.08 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3113  HTH-type transcriptional regulator RafR  31.2 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  30.45 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.03 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  29.28 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  27.25 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  29.06 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.53 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.35 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  27.17 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.53 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3379  HTH-type transcriptional regulator RafR  31.2 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.14 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.14 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  27.45 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.7 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.35 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  25.94 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.51 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 332 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.51 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  25.51 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  29.14 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.51 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2567  LacI family transcription regulator  30.17 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.51 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  25.51 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.51 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  29.1 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.47 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.57 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>