More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4163 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.48 
 
 
285 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 
282 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4364  luciferase-like protein  31.38 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.390419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3922  luciferase family protein  32.08 
 
 
293 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3907  luciferase-like protein  32.08 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.84 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3981  luciferase family protein  32.08 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389653  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  31.63 
 
 
336 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  30.22 
 
 
288 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3229  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.64 
 
 
293 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4383  luciferase family protein  30.72 
 
 
291 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.722636  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  33.63 
 
 
293 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.07 
 
 
288 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  39.18 
 
 
278 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2283  luciferase family protein  31.31 
 
 
296 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 
289 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.5 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  34.56 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  32.68 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.33 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.85 
 
 
299 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.41 
 
 
293 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.2 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  36.81 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  36.65 
 
 
296 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  34.62 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.9 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 
328 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  36.91 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  36.2 
 
 
295 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  30.85 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  29.33 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.16 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6991  luciferase family protein  28.12 
 
 
306 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  32.29 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  32.29 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  32.13 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  28.96 
 
 
334 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  32.58 
 
 
322 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  32.65 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.91 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  32.16 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  31.62 
 
 
342 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.13 
 
 
314 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  28.03 
 
 
293 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  28.03 
 
 
293 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  34.48 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  30.47 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  28.03 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  26.29 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  33.16 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  33.33 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  31.42 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.27 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  31.91 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  31.46 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  32.65 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  27.87 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  31.44 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.16 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  30.48 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  29.96 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  30.73 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  30.73 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  30.99 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  30.28 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  30.93 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  37.64 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  30.88 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.43 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  31.12 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  30.47 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  30.88 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 
519 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  29.46 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  30.96 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  27.65 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4899  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.13 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  29.84 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  28.7 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  28.95 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  35.36 
 
 
753 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  31.86 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  33.14 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  32.28 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  29.57 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  30.28 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  31.63 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  29.65 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>