More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3169 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
302 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  35.61 
 
 
279 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
294 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
279 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  37.14 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  37.46 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
293 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.41 
 
 
335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  39.23 
 
 
269 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
285 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
280 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
280 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  38.43 
 
 
283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.38 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.43 
 
 
283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  38.43 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  38.43 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
283 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
283 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.01 
 
 
306 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
289 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00661065  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
867 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
285 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
289 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal  0.758242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
283 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
260 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
287 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
278 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
290 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
297 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
296 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
297 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.85 
 
 
289 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
287 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
276 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
279 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
297 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
299 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
291 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
299 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
300 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
299 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.64 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.25 
 
 
276 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
280 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
290 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.786779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.57 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.369751  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
299 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
301 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
299 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
279 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
818 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  39.39 
 
 
288 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
285 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
308 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
302 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  35.52 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  35.52 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  35.52 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  35.52 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.63 
 
 
321 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5089  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.39 
 
 
293 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
299 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  37.05 
 
 
276 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.52 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
276 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
294 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
301 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
311 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  35.37 
 
 
299 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
301 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
310 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 
288 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  36.84 
 
 
279 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
332 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.89 
 
 
289 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
304 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
319 aa  148  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>