More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1780 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 
452 aa  899    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  69.84 
 
 
446 aa  599  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  63.02 
 
 
477 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  61.66 
 
 
452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  59.38 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.56 
 
 
452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.7 
 
 
452 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  55.25 
 
 
453 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.74 
 
 
430 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  55.27 
 
 
512 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  52.79 
 
 
429 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.77 
 
 
439 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.62 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.62 
 
 
465 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.11 
 
 
465 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  39.81 
 
 
436 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  42.9 
 
 
394 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.03 
 
 
446 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.63 
 
 
420 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.97 
 
 
455 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.49 
 
 
454 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.78 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.78 
 
 
454 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  36.26 
 
 
487 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.44 
 
 
457 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.84 
 
 
466 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.34 
 
 
455 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.83 
 
 
456 aa  209  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.8 
 
 
453 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.3 
 
 
454 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.31 
 
 
449 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.86 
 
 
454 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.47 
 
 
454 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.63 
 
 
491 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.68 
 
 
474 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.19 
 
 
456 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.28 
 
 
453 aa  206  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.19 
 
 
456 aa  206  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.17 
 
 
456 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.79 
 
 
452 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.44 
 
 
458 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.96 
 
 
456 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  34.09 
 
 
454 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.02 
 
 
454 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.89 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.86 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.78 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.1 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.1 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.43 
 
 
469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.33 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.51 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.55 
 
 
454 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.33 
 
 
458 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.33 
 
 
458 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.33 
 
 
458 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.93 
 
 
468 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.33 
 
 
462 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.1 
 
 
473 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.9 
 
 
466 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.64 
 
 
454 aa  193  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.09 
 
 
455 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.49 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.3 
 
 
462 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.56 
 
 
477 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.16 
 
 
460 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.16 
 
 
460 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.16 
 
 
460 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.16 
 
 
460 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.16 
 
 
460 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.8 
 
 
449 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.16 
 
 
460 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.23 
 
 
460 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.75 
 
 
483 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.83 
 
 
460 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.54 
 
 
468 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.9 
 
 
464 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.25 
 
 
476 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.02 
 
 
452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.59 
 
 
455 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.65 
 
 
448 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.38 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.04 
 
 
448 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.16 
 
 
450 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.22 
 
 
459 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.93 
 
 
456 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.69 
 
 
457 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  31.23 
 
 
481 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.86 
 
 
686 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.44 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.78 
 
 
455 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  30.83 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.53 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  30.89 
 
 
460 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.08 
 
 
450 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.49 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  30.5 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.79 
 
 
454 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.6 
 
 
454 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.1 
 
 
454 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>