More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0242 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  72.77 
 
 		 202 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  41.09 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  40.61 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  40.61 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  40.61 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  40.61 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  40.61 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  40.31 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  40.1 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  38.27 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  38.27 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  38.27 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  33.85 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  41.33 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  33.17 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  38.24 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  30.23 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  34.5 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  35.82 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  38.92 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  31.31 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  39.49 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  39.49 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  34.48 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  34.01 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  38.22 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  33.92 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  35.12 
 
 		 362 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  35.12 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  34.5 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  35.12 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  41.1 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  33.92 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 349 aa  75.1  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  31.87 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  32.72 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  31.87 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  32.18 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  33.12 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  35.29 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  31.93 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  31.87 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  31.87 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  31.87 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  32.76 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  31.87 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  31.87 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  31.93 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  32.53 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  31.87 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  31.87 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  31.87 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  31.87 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  31.61 
 
 		 358 aa  72  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 391 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  32.76 
 
 		 300 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 391 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 391 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  30.81 
 
 		 372 aa  71.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  32.18 
 
 		 367 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  32.18 
 
 		 367 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  31.87 
 
 		 459 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  30.41 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  31.84 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1395  peptide chain release factor 1  30.41 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  27.46 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1098  peptide chain release factor 1  31.18 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.516502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  27.72 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  31.4 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  36.44 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  30.72 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  29.02 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  31.95 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  31.4 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  31.4 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  36.36 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  31.98 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  32.95 
 
 		 354 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1767  peptide chain release factor 2  32.12 
 
 		 337 aa  68.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  31.74 
 
 		 375 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  31.64 
 
 		 361 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  54.1 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  31.25 
 
 		 349 aa  68.6  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  31.98 
 
 		 376 aa  68.2  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  30.23 
 
 		 367 aa  68.6  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  35.29 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  30.57 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  31.18 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  36.36 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  31.21 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  31.18 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  30.41 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>