70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0912 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  70.22 
 
 
577 aa  855    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  63.68 
 
 
576 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1202    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  60.48 
 
 
577 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  62.82 
 
 
576 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  59.28 
 
 
577 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  59.31 
 
 
571 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  59.28 
 
 
577 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  62.65 
 
 
576 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  56.23 
 
 
576 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  31.3 
 
 
602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.23 
 
 
566 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25.23 
 
 
566 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  24.86 
 
 
566 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  24.67 
 
 
566 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  26.27 
 
 
566 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  25.5 
 
 
566 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  25.18 
 
 
566 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  24.86 
 
 
566 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.56 
 
 
580 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.66 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  26.75 
 
 
770 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  26.8 
 
 
449 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  24.15 
 
 
768 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  21.95 
 
 
772 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  29.14 
 
 
720 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  29.14 
 
 
720 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  22.89 
 
 
519 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  29.14 
 
 
720 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  26.94 
 
 
327 aa  58.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  24.63 
 
 
291 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.37 
 
 
770 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  25.49 
 
 
226 aa  57.4  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  23.3 
 
 
691 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  25.69 
 
 
769 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  25.69 
 
 
769 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  22.4 
 
 
770 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  21.34 
 
 
769 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  22.17 
 
 
770 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  22.14 
 
 
770 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  22.17 
 
 
770 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  25.59 
 
 
759 aa  54.3  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  22.6 
 
 
838 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  22.03 
 
 
838 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  25.25 
 
 
722 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  25.25 
 
 
722 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  23.67 
 
 
836 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  24.64 
 
 
755 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  23.51 
 
 
361 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  30.77 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  22.03 
 
 
838 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  23.74 
 
 
621 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  25.25 
 
 
722 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  26.02 
 
 
440 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 
722 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  20.4 
 
 
755 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  30.39 
 
 
134 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  23.75 
 
 
332 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  25.82 
 
 
300 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  27.66 
 
 
239 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  24.74 
 
 
534 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  25.51 
 
 
354 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  30.43 
 
 
614 aa  47.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2460  hypothetical protein  26.1 
 
 
347 aa  47.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000292173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  23.89 
 
 
240 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  20.13 
 
 
757 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4778  hypothetical protein  26.73 
 
 
404 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  26.97 
 
 
178 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  30.68 
 
 
178 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  31.11 
 
 
171 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>