More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3641 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3641  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1678  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  56.49 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0213  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.16 
 
 
309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50166  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0014  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.16 
 
 
309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.709521  normal  0.0140124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1342  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
307 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1863  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.22 
 
 
310 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1274  ABC transporter related  34 
 
 
303 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0038  ABC transporter related  33.07 
 
 
270 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0193183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5586  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 
511 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249808  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 
669 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1468  ABC transporter related protein  30.57 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  33.33 
 
 
546 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  33.07 
 
 
565 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  31.89 
 
 
561 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.86 
 
 
548 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 
539 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4716  ABC transporter related  31.35 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  35.44 
 
 
547 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0129  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.72 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2200  ABC transporter related  34.75 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0704641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
544 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  31.05 
 
 
557 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2553  ABC transporter related  33.48 
 
 
291 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.499452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  33.62 
 
 
534 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  29.92 
 
 
557 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  35.48 
 
 
547 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  33.48 
 
 
538 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  31.05 
 
 
557 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0982  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.33 
 
 
334 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  31.4 
 
 
531 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2053  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 
644 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05950  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  36.02 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.149541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3548  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.32 
 
 
343 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.927154  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34900  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  32.37 
 
 
297 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 
278 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.33 
 
 
564 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2309  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 
643 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.819417  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_002620  TC0062  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  31.58 
 
 
562 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2059  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.09 
 
 
694 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  33.19 
 
 
542 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.24 
 
 
330 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.8 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.62 
 
 
610 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  28.99 
 
 
557 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0190  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  31.52 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.28364  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  32.34 
 
 
640 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  31.97 
 
 
623 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  34.9 
 
 
467 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5410  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.71 
 
 
330 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0091  dipeptide transporter ATP-binding subunit  31.4 
 
 
326 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.887805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  32.19 
 
 
534 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4863  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.71 
 
 
330 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219128  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4059  dipeptide transporter ATP-binding subunit  31.4 
 
 
326 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.94 
 
 
524 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4072  dipeptide transporter ATP-binding subunit  31.4 
 
 
326 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1016  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.74 
 
 
662 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.21 
 
 
337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4564  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
518 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.35 
 
 
324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188886  normal  0.0439105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.2 
 
 
325 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  30.71 
 
 
530 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0185  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATPase subunit  29.92 
 
 
334 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0187  dipeptide transporter ATP-binding subunit  30.62 
 
 
327 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235094  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  32.06 
 
 
623 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2772  ABC transporter related  31.47 
 
 
269 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0679  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.05 
 
 
327 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1812  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  30.38 
 
 
328 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1010  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.51 
 
 
328 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0991  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.51 
 
 
328 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3266  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.34 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496309  normal  0.0441332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  30.12 
 
 
527 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  32.16 
 
 
540 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  32.03 
 
 
546 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2911  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.53 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  31.2 
 
 
540 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07043  ABC-type transporter ATPase componen  31.2 
 
 
284 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
539 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.6 
 
 
342 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898182  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  32.77 
 
 
318 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0223  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
330 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  33.2 
 
 
631 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.92 
 
 
334 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  29.27 
 
 
671 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3037  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.92 
 
 
332 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  34.38 
 
 
565 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2959  ABC transporter related  32.91 
 
 
599 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5119  ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 
324 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.33 
 
 
327 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  31.76 
 
 
546 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5321  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.1 
 
 
330 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525379  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6687  ABC transporter related  32.3 
 
 
267 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  0.477778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58470  ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 
324 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.868458  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5539  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.1 
 
 
330 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0658459  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3461  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.05 
 
 
386 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414983  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0938  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.51 
 
 
332 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5671  ABC transporter related  31.08 
 
 
271 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>