More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2553 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2553  ABC transporter related  100 
 
 
291 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.499452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1274  ABC transporter related  59.06 
 
 
303 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1863  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.51 
 
 
310 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1342  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 
307 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0213  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  52.12 
 
 
309 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50166  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0014  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  51.35 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.709521  normal  0.0140124 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1468  ABC transporter related protein  48.08 
 
 
265 aa  256  5e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0038  ABC transporter related  51.18 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0193183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1326  ATPase  48.87 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.406324  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0190  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 
267 aa  237  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2200  ABC transporter related  45.83 
 
 
373 aa  222  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0704641  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3069  ABC transporter related  42.86 
 
 
269 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0301743  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1034  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.83 
 
 
309 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.32 
 
 
610 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1981  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
312 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.7 
 
 
328 aa  149  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.97058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0044  hypothetical protein  34.12 
 
 
307 aa  148  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.616178  normal  0.403323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3036  ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  35.87 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1668  ABC transporter related  37.45 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0447  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0930443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2029  ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2744  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  35.09 
 
 
301 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1612  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 
347 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  39.1 
 
 
565 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3673  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  normal  0.0506665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0400  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.57 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2299  oligopeptide transporter ATP-binding component  33.21 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 
346 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 
610 aa  145  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  35.09 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  36.16 
 
 
619 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  34.88 
 
 
566 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0642  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 
312 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3550  nickel ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
268 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0066786  normal  0.0642256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1128  ABC transporter related  37.07 
 
 
268 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1074  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
268 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0983  ABC transporter related  32.95 
 
 
260 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0278331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.7 
 
 
332 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  33.81 
 
 
577 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0728  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
339 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  35.61 
 
 
534 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0717  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
339 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000354722 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0660  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
339 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0789  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
339 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00764009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1281  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
313 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0717  hypothetical protein  34.9 
 
 
312 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.701444 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
308 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367926  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  34.55 
 
 
693 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.867925  normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  35.21 
 
 
304 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  32.79 
 
 
350 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1528  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
282 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2380  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.7 
 
 
331 aa  142  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0497276  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.23 
 
 
536 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  34.72 
 
 
304 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  35.23 
 
 
606 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  34.72 
 
 
304 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  34.72 
 
 
304 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  37.69 
 
 
539 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0637  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  35.23 
 
 
536 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1082  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0679  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.69 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  34.34 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0064  ABC transporter related  35.96 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.080587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  35.47 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3504  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.55 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.307632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3795  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.35 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  36.36 
 
 
539 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4131  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.93 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0982  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.33 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  31.14 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1583  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.96 
 
 
282 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282414  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 
345 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.66 
 
 
548 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  35.23 
 
 
320 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  36.36 
 
 
539 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1585  ABC transporter related  34.96 
 
 
282 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2698  oligopeptide transporter ATP-binding component  33.21 
 
 
338 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00275674  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  34.19 
 
 
304 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 
337 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.276741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1957  oligopeptide transporter ATP-binding component  32.84 
 
 
333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.473899  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  34.33 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0574  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1988  oligopeptide transporter ATP-binding component  34.72 
 
 
331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0214  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  31.88 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00264337  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2289  oligopeptide transporter ATP-binding component  35.58 
 
 
331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.038391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1415  oligopeptide transporter ATP-binding component  33.09 
 
 
337 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.62339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01220  oligopeptide transporter ATP-binding component  33.09 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0846377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1394  oligopeptide transporter ATP-binding component  33.09 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.430966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2160  oligopeptide transporter ATP-binding component  32.84 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00241569  normal  0.0324737 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1009  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2067  oligopeptide transporter ATP-binding component  32.84 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.702331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1355  oligopeptide transporter ATP-binding component  33.09 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00010775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0236  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.66 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.311885  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0219  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.59 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.580766 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2382  oligopeptide transporter ATP-binding component  33.09 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  hitchhiker  0.0000013804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>