More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1188 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
610 aa  1192    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  39 
 
 
602 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
703 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  39.23 
 
 
603 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  41.91 
 
 
686 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
708 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 
690 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.69 
 
 
676 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 
674 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.85 
 
 
695 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
615 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2030  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.88 
 
 
642 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.31 
 
 
619 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.93 
 
 
711 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
620 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  36.64 
 
 
564 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 
677 aa  409  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  43.72 
 
 
658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 
659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.48 
 
 
613 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  40.84 
 
 
601 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  42.55 
 
 
612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.86 
 
 
612 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.18 
 
 
611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  43.44 
 
 
628 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  40.34 
 
 
610 aa  405  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.28 
 
 
749 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 
680 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  38.19 
 
 
578 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  41.34 
 
 
562 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7097  glutathione import ATP-binding protein GsiA  40.51 
 
 
718 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
725 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.51 
 
 
671 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.26 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  40.39 
 
 
712 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
691 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
665 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
609 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
725 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.81 
 
 
756 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 
736 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  40.47 
 
 
543 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  42.48 
 
 
571 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.38 
 
 
615 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  39.56 
 
 
553 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  41.14 
 
 
601 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  43.65 
 
 
613 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  40.4 
 
 
597 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.68 
 
 
699 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  40.79 
 
 
611 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  40.41 
 
 
533 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.6 
 
 
617 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  39.63 
 
 
530 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 
611 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
593 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  40.47 
 
 
543 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 
611 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  38.99 
 
 
593 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 
539 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  41.68 
 
 
595 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  41.07 
 
 
611 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.32 
 
 
610 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  39.09 
 
 
542 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.88 
 
 
594 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  41.46 
 
 
640 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.26 
 
 
620 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  40.17 
 
 
611 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 
725 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.76 
 
 
643 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.6 
 
 
632 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  39.2 
 
 
611 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  39.41 
 
 
583 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
905 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
633 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1494  ABC transporter ATP-binding protein  40.1 
 
 
530 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.475677  normal  0.971253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
625 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 
623 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.95 
 
 
566 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  39.5 
 
 
623 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  36.92 
 
 
617 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.5 
 
 
612 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  39.13 
 
 
529 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.798953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
623 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 
623 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
623 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 
608 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  39.5 
 
 
612 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  40.03 
 
 
623 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  39.33 
 
 
623 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  41.29 
 
 
640 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  41.3 
 
 
579 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
623 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.8 
 
 
626 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  39.9 
 
 
629 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  38.89 
 
 
530 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  40.79 
 
 
537 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.9 
 
 
625 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
540 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>