More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4464 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 324 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  44.69 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  46.82 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 320 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  41.49 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  40.99 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  39.57 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  39.57 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  40.87 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  40.99 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  43.37 
 
 		 329 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  40.87 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  39.06 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  43.77 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  43.47 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4069  hypothetical protein  42.51 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487038  normal  0.116036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  37.31 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  40.91 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  42.72 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  41.95 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  42.72 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  41.14 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  42.37 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1198  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 		 318 aa  225  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  41.46 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  38.32 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  43.57 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  40.49 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  37.01 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  38.81 
 
 		 337 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  39.76 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  39.69 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  40.24 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  41.74 
 
 		 329 aa  222  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  40.73 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  40.49 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  40.49 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  35.92 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  35.92 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  36.96 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  36.95 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  35.92 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  35.92 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  35.92 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  39.18 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  37.05 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  37.85 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  41.64 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  36.21 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  39.56 
 
 		 327 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  35.47 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  42.68 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  40.56 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  40.92 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  38.23 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  37.85 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  41.96 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  39.46 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  39.32 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  42.77 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  41.49 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  40.25 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  36.49 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  39.2 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  38.55 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  38.99 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  36.02 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  42.27 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  40.72 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  37.42 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  41.1 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  42.63 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  35.63 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  41.88 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  39.38 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  37.35 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  36.49 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  36.42 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  38.6 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  38.46 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  35.92 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  35.89 
 
 		 337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  39.01 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  37.1 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 		 334 aa  212  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  35.63 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  39.1 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  35.92 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  36.36 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  39.51 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>