More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1068 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 414 aa  837    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 414 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 416 aa  358  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  42.3 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 423 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 413 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 413 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 419 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 423 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 415 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 419 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 415 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 429 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 429 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 422 aa  339  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 428 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 429 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 428 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 411 aa  335  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 424 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 429 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 429 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 429 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 417 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 429 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 446 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 423 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  40.29 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 418 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 430 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1252  histidyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  42.89 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>