More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0724 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0724  NUDIX hydrolase  100 
 
 
177 aa  358  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
163 aa  140  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  40 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
361 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
188 aa  61.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  31.25 
 
 
361 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.41 
 
 
206 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  32.28 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  35.34 
 
 
179 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  32 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  27.34 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.11 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.11 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
362 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  28.03 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  31.65 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.2 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.9 
 
 
210 aa  55.1  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
190 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
209 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
205 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  35.37 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 
203 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
335 aa  54.3  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  45 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.54 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.59 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  26.92 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  34.94 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  30.66 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  30.87 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  28.57 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  27.93 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  28.57 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  30.16 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  33.61 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.86 
 
 
196 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.86 
 
 
196 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
171 aa  52  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.86 
 
 
196 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  28.86 
 
 
196 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.86 
 
 
196 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  28.86 
 
 
196 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 
182 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
199 aa  51.6  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  28.86 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  27.15 
 
 
209 aa  51.2  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  29.03 
 
 
189 aa  51.2  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  30.32 
 
 
187 aa  50.8  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0092  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.03 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.09 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  34.09 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38092  predicted protein  41.77 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00931034  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>