More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5687 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 765 aa  1562    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  70.72 
 
 		 763 aa  1073    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  55.31 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  53.07 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  49.87 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  53.3 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  51.82 
 
 		 381 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  51.19 
 
 		 392 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  39.28 
 
 		 1293 aa  249  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  38.52 
 
 		 402 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  38.5 
 
 		 383 aa  234  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 		 379 aa  114  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 384 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 412 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 398 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 386 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 378 aa  99.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 364 aa  98.2  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 412 aa  97.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 387 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 386 aa  95.5  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 516 aa  95.5  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 379 aa  95.5  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 385 aa  94.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 350 aa  94.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 		 365 aa  94  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 381 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 364 aa  93.2  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 403 aa  92.4  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  33.69 
 
 		 346 aa  91.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 398 aa  90.9  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 374 aa  90.9  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  22.08 
 
 		 424 aa  90.5  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 414 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 360 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 438 aa  89.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 420 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 387 aa  89.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 420 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 373 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 390 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 371 aa  88.6  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 339 aa  87.8  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 387 aa  88.2  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  32.28 
 
 		 395 aa  87.8  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 385 aa  87.8  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 425 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 389 aa  87.8  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 364 aa  87.8  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 394 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 404 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 385 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 381 aa  86.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 409 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1517  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 366 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  34.36 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.49 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.68 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  27.57 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 361 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 370 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 377 aa  83.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.6 
 
 		 388 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 438 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 		 379 aa  84  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 453 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 384 aa  83.2  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.86 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  31.07 
 
 		 745 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.86 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.86 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.86 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>