More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5349 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 437 aa  905    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  40.09 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  40.33 
 
 		 443 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  40.56 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  40.05 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  38.62 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  31.07 
 
 		 469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  29.59 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  29.95 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0246  Glutamate--ammonia ligase  29.9 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0602  L-glutamine synthetase  30.37 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.328927 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  26.73 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  27.27 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  27.19 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  27.19 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  29.21 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  27.27 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  29.8 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  28.91 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  27.05 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  28.28 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  27.84 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  26.33 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  29.28 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  29.87 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  28.37 
 
 		 446 aa  136  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  27.78 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  27.71 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  28.02 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  27.64 
 
 		 456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  28.81 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  27.58 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  28.02 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  29 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  26.96 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  27.34 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  28.08 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  27.27 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  29.07 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  27.54 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  27.4 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  28.33 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  27.95 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  28.31 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  27.65 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  27.01 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  28.93 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  27.17 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  27.17 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  27.21 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  27.29 
 
 		 444 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.62 
 
 		 447 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  26.75 
 
 		 496 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  27.75 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  27.29 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  27.61 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  27.05 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  27.05 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  27.05 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  27.76 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  27.05 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  26.54 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  27.05 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  26.51 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  27.99 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  29.11 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  27.1 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  26.87 
 
 		 453 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  27.55 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  26.38 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  26.38 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  26.33 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  27 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  27.32 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  27.83 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  26.68 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  26.81 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  27.19 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  26.71 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  25.93 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  27.4 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  26.96 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  27.41 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  26.45 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  24.24 
 
 		 448 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  27.5 
 
 		 452 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  28.17 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  28.17 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  30.42 
 
 		 450 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  25.9 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  27.14 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  25.96 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  28.61 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  25.96 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  25.97 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  25.6 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  25.96 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  26.92 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  27.96 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>