More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3610 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  75.35 
 
 		 511 aa  760    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 509 aa  1026    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  80.92 
 
 		 509 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  56.05 
 
 		 503 aa  561  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  39.32 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  37.65 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  37.42 
 
 		 502 aa  319  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  35.7 
 
 		 498 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  35.7 
 
 		 498 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  35.5 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  35.63 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  35.5 
 
 		 498 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  35.09 
 
 		 498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  35.22 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  35.22 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  35.22 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  35.22 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  35.22 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  35.02 
 
 		 498 aa  309  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  37.15 
 
 		 505 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  35.13 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  36.33 
 
 		 504 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  33.67 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  32.94 
 
 		 498 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  32.94 
 
 		 498 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  32.94 
 
 		 498 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  34.24 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.31 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  36.55 
 
 		 511 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.09 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.44 
 
 		 500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.67 
 
 		 509 aa  230  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  35.87 
 
 		 503 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.92 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.87 
 
 		 503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.86 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.09 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  29.51 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.83 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.72 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.04 
 
 		 530 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.57 
 
 		 502 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  28.83 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  29.39 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  31.35 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.89 
 
 		 500 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  32.67 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.37 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  29.13 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.99 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.58 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.25 
 
 		 506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.69 
 
 		 496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.84 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.84 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.09 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.71 
 
 		 530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.84 
 
 		 530 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.71 
 
 		 530 aa  183  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.94 
 
 		 503 aa  183  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  30.71 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.71 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  30.91 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.53 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  32.07 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.82 
 
 		 520 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.72 
 
 		 497 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.52 
 
 		 530 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.38 
 
 		 504 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  31.03 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  31.03 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.92 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.83 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.88 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.83 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.83 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.94 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  30.44 
 
 		 526 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  32.69 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.18 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.07 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.11 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.93 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  33.71 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.93 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.67 
 
 		 513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  28.88 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.56 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  31.66 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.47 
 
 		 513 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.47 
 
 		 513 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  29.72 
 
 		 493 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.51 
 
 		 524 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.74 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.73 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.47 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.09 
 
 		 548 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>