More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2151 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0868  DeoR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
254 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0815  DeoR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
254 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2907  DeoR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  50.6 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  48.59 
 
 
258 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  45.75 
 
 
287 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  45.81 
 
 
261 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4074  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 
262 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798271  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32060  transcriptional regulator of sugar metabolism  43.88 
 
 
262 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5318  transcriptional regulator, DeoR family  39.48 
 
 
280 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0804  DeoR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
294 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2916  DeoR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
289 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  38.21 
 
 
277 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13310  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.57 
 
 
259 aa  168  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1511  transcriptional regulator, DeoR family  40.35 
 
 
280 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.683397  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  39.04 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
267 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  31.52 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
255 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
255 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.37 
 
 
265 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  31.37 
 
 
265 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  32.3 
 
 
250 aa  129  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  31.52 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.92 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.62 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  36.24 
 
 
257 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 
256 aa  125  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
257 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
274 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4365  transcriptional regulator, DeoR family  36.28 
 
 
262 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
257 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  31.35 
 
 
253 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  33.75 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  30.2 
 
 
257 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
251 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  30.2 
 
 
257 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  30.2 
 
 
257 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.86 
 
 
278 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  30.2 
 
 
257 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  27.09 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  32.08 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.76 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.06 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  29.8 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.4 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.57 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.29 
 
 
269 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.29 
 
 
269 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  28.29 
 
 
269 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.29 
 
 
269 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  30.56 
 
 
252 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 
252 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.29 
 
 
269 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  28.29 
 
 
269 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.29 
 
 
269 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
260 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.33 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.33 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.33 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.33 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
256 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
256 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
256 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
256 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 
273 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 
252 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
258 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  31.98 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>