More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3985 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  73.84 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  70.46 
 
 		 240 aa  343  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  70.04 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  49.56 
 
 		 247 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  40.43 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  39.04 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  42.31 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  42.54 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  44.83 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  45.15 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  45.54 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  39.74 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  40.35 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  38.98 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  39.57 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  43.86 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  43.23 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  41.63 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  38.7 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  40 
 
 		 241 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  40.19 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.6 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  35.05 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  38.27 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  40.43 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  31.8 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  36.77 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35.23 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  32.64 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  26.82 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  40.16 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  34.83 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.76 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  35.44 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  35.91 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  36.2 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  35.44 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  28.78 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  31.28 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  37.82 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  34.43 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.59 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.78 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.53 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  36.13 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  36.55 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  30.99 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  38.26 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.69 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  30 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  26.07 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  37.4 
 
 		 513 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  42.06 
 
 		 516 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  28.91 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  40.54 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  34.45 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  30.41 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  37.1 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  37.1 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  31.86 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  30.3 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  31.21 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  39.37 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  34.45 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  31.53 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  37.25 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  32.14 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  29.34 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.05 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  31.82 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  30.61 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  28.74 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  30.19 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  35.51 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  30.61 
 
 		 509 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  29.1 
 
 		 511 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  29.22 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  32.31 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>