More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3484 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  73.25 
 
 		 231 aa  309  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  71.43 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.43 
 
 		 235 aa  295  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.34 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.16 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.71 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.93 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00591896  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.93 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.96 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0113  ABC transporter, permease protein  58.48 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.48 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.46 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.38 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  56.82 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  56.82 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.54 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  46.76 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.15 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.78 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.78 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  53.69 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.41 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.28 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  51.03 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 		 213 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.03 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  50 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  46.54 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.01 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.22 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.47 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  47.09 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.74 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  44.75 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.21 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  49.44 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  46.53 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  46.31 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  46.31 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  46.01 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  58.9 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.62 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  47.78 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  47.5 
 
 		 213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.34 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  45.41 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  45.41 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.06 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.3 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.06 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.06 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  57.67 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 217 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  57.06 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 217 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 217 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  57.67 
 
 		 217 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0490  ABC transporter, permease protein  47.42 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.507412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  45.89 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  45.89 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  45.89 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>