More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1684 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
104 aa  213  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  65.05 
 
 
111 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  65.05 
 
 
111 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 
104 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  64 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  63 
 
 
107 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  61.62 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  58.82 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  57.43 
 
 
268 aa  126  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  57.58 
 
 
263 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  55.56 
 
 
268 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  53.47 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  53.54 
 
 
250 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  56.44 
 
 
263 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  49.51 
 
 
257 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
247 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 
250 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 
250 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  51.69 
 
 
250 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.66 
 
 
270 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  54.12 
 
 
106 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.69 
 
 
260 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  48.86 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  47.13 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  43 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3302  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  38.38 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39 
 
 
288 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  38.61 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38 
 
 
240 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  40 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0457  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  32.58 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>