29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5097 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  100 
 
 
727 aa  1480    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.39 
 
 
720 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  39.38 
 
 
989 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.97 
 
 
1068 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  32.57 
 
 
831 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.76 
 
 
665 aa  240  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  36.96 
 
 
792 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  38.03 
 
 
990 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  32.92 
 
 
661 aa  190  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.83 
 
 
571 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.8 
 
 
618 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.95 
 
 
608 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  25.68 
 
 
413 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1118  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.37 
 
 
289 aa  61.2  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  35.9 
 
 
827 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  26.19 
 
 
1275 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.07 
 
 
1547 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  37.66 
 
 
617 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  29.17 
 
 
561 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  32.05 
 
 
112 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  26.43 
 
 
1295 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.52 
 
 
2833 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.47 
 
 
938 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2589  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  20.56 
 
 
661 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541867  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.32 
 
 
2270 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  32 
 
 
654 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  27.17 
 
 
1003 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  26.58 
 
 
1024 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
434 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>