35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1809 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  40.68 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  35.78 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  32 
 
 		 847 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  32.02 
 
 		 847 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  29.91 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  27.07 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  27.15 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  28.39 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  25.41 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  25.94 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  26.89 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  27.27 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  26.42 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  23.41 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  26.13 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  27.02 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  22.08 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  22.69 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  24.39 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  26.02 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  23.76 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  24.14 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  26.32 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  23.81 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  22.05 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  21.56 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  23.83 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03655  hypothetical protein  23.21 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  22.49 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>