More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1656 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1656  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 225 aa  470  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 220 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  62.57 
 
 		 210 aa  241  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  51.19 
 
 		 181 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  50.9 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 182 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 		 178 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.96 
 
 		 184 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.9 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  39.81 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  48.55 
 
 		 175 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  39.82 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.67 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46.75 
 
 		 180 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  48.05 
 
 		 158 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  45.61 
 
 		 176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 		 179 aa  161  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  50.6 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  40.55 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  38.25 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 		 182 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  46.37 
 
 		 182 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  46.47 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  40.74 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  44.85 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  45.61 
 
 		 182 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  45.56 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.06 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.85 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  43.01 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  48.39 
 
 		 181 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  52.82 
 
 		 156 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.63 
 
 		 186 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  49.1 
 
 		 177 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  48.12 
 
 		 184 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 162 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.7 
 
 		 284 aa  154  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  40.65 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  48.63 
 
 		 150 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  43.65 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 338 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  51.37 
 
 		 155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  47.88 
 
 		 209 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.35 
 
 		 290 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09460  methionine-S-sulfoxide reductase  46.47 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.86 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  41.72 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.17 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  45.73 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  45.73 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  43.71 
 
 		 177 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  42.11 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  43.11 
 
 		 180 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.13 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 		 183 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  45.95 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.91 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  43.2 
 
 		 175 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  49.3 
 
 		 162 aa  148  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  49.31 
 
 		 165 aa  148  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  44.57 
 
 		 236 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  42.01 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  41.01 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  43.9 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  44.85 
 
 		 416 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  43.58 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  43.58 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  41.76 
 
 		 179 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  43.02 
 
 		 186 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  43.52 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.7 
 
 		 287 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  42.11 
 
 		 180 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  45.51 
 
 		 179 aa  145  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  43.52 
 
 		 246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2194  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  38.3 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  48.65 
 
 		 353 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  44.91 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.52 
 
 		 416 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  42.45 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  41.32 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  45.6 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.61 
 
 		 334 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  41.76 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  40.24 
 
 		 173 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2445  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 174 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>