More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1292 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1292  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 228 aa  188  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  42.79 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.2 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.33 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0577  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0903513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  40.27 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 266 aa  175  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  43.75 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 241 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.3 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  42.48 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  43.36 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  43.36 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.97 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  40.99 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  40.99 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.48 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.48 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  41.89 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1809  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.48 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  40.62 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.48 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  41.44 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  39.65 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>