More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
268 aa  536  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  45.53 
 
 
264 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  47.08 
 
 
308 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  44.72 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  44.08 
 
 
261 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 
285 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 
267 aa  105  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  35.95 
 
 
274 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
265 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
270 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
267 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.06 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.06 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.91 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.91 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.8 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0367  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
207 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.71 
 
 
285 aa  89  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
267 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
269 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
285 aa  89  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.08 
 
 
205 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.78 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  31.67 
 
 
306 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  30.27 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
278 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  34.14 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  31.36 
 
 
396 aa  82.4  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.13 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
301 aa  82  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  31.43 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.78 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.11 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  27.76 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.22 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  25.98 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  24.09 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.09 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  26.8 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.72 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.87 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.09 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.54 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3521  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.77 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0376  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338833  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  30.86 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>