41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  54.25 
 
 
873 aa  715    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  57.56 
 
 
859 aa  852    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  100 
 
 
872 aa  1690    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  56.89 
 
 
862 aa  858    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  51.96 
 
 
916 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  33.89 
 
 
801 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  34.88 
 
 
793 aa  337  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  30.08 
 
 
853 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  34.47 
 
 
843 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  27.83 
 
 
811 aa  283  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  31.01 
 
 
854 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  32.53 
 
 
792 aa  267  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  31.91 
 
 
809 aa  258  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  30.97 
 
 
773 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  28.28 
 
 
803 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  35.09 
 
 
783 aa  201  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  28.66 
 
 
795 aa  200  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  26.99 
 
 
795 aa  157  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  28.21 
 
 
787 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  28.21 
 
 
787 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  27.9 
 
 
787 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  34.64 
 
 
313 aa  129  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  34.41 
 
 
293 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  29.75 
 
 
442 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  30.57 
 
 
447 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  28.12 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  48.72 
 
 
341 aa  58.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  26.07 
 
 
348 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  31.03 
 
 
339 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  23.91 
 
 
346 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  42.67 
 
 
341 aa  51.2  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  32.74 
 
 
345 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  39.39 
 
 
339 aa  50.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  27.65 
 
 
318 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  39.58 
 
 
342 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  30.97 
 
 
345 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  24.14 
 
 
334 aa  48.5  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  41.07 
 
 
329 aa  48.5  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  44.59 
 
 
337 aa  48.5  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  30.66 
 
 
339 aa  48.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  37.5 
 
 
322 aa  44.3  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>