More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  100 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  79.14 
 
 		 140 aa  200  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  54.01 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  50.36 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  46.72 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  48.53 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  46.04 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  50.82 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  42.22 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  43.8 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.5 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  43.8 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  43.8 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  38.06 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  44.44 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.56 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.69 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 164 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  41.04 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  39.42 
 
 		 161 aa  95.9  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  42.14 
 
 		 172 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  36.3 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.81 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  36.3 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  39.42 
 
 		 169 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  36.3 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  38.24 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  36.03 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  39.26 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  35.56 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  38.24 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  38.24 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  39.1 
 
 		 167 aa  93.6  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  38.24 
 
 		 167 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  34.78 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  33.33 
 
 		 218 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.59 
 
 		 161 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  42.22 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  37.96 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.81 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  37.04 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  37.04 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.81 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  33.33 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.07 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 159 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  37.41 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.58 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  33.58 
 
 		 161 aa  90.1  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.07 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.82 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  30.22 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.85 
 
 		 170 aa  88.6  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  33.82 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  36.57 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.12 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  33.06 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  36.76 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.82 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  30.94 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.56 
 
 		 174 aa  87.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  37.9 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  31.62 
 
 		 163 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.13 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  30.6 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.13 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  38.69 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.81 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  29.2 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.04 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.81 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34.81 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.63 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.63 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.29 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  31.34 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  31.34 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  34.04 
 
 		 187 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  28.36 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.86 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  32.09 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  28.57 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>