73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.88 
 
 		 318 aa  351  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  64.26 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  62.59 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  62.24 
 
 		 319 aa  328  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.7 
 
 		 343 aa  321  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  62.59 
 
 		 325 aa  319  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.96 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  63.03 
 
 		 323 aa  298  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  50 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.93 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.12 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.37 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.37 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.84 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.46 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.81 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.7 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.79 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.31 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.06 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.22 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.48 
 
 		 234 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  30.22 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.37 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.47 
 
 		 233 aa  95.9  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 244 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.84 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.07 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  31.05 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  24.91 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.34 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.71 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.53 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.53 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  47.47 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  25.4 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.4 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  23.85 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  40 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.25 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  37.86 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  32.19 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  34.74 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.24 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.89 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.77 
 
 		 192 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.82 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.36 
 
 		 220 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.85 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.56 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  34.72 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  24.43 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  34 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.44 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  32.99 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  26.67 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.09 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.05 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.67 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  30.1 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.98 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.07 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.1 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.99 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0394  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.7 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187163  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.7 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0981  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.7 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00626299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>