54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2878 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  85.55 
 
 		 533 aa  937    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  76.43 
 
 		 524 aa  821    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  71.51 
 
 		 526 aa  760    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  94.44 
 
 		 576 aa  1126    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1192    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  96.35 
 
 		 576 aa  1153    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  31.93 
 
 		 1408 aa  179  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.23 
 
 		 1107 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1108 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 1410 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  32.8 
 
 		 1410 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 1422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  28.54 
 
 		 478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  27.63 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  28.06 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  26.92 
 
 		 478 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  26.84 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  30 
 
 		 480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  29.1 
 
 		 480 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  29.63 
 
 		 480 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  27.3 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  29.89 
 
 		 826 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.07 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.33 
 
 		 1222 aa  93.6  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.4 
 
 		 921 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  28.68 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  23.33 
 
 		 743 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  26.82 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  25.1 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  24.52 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  24.52 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  29.41 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  25.82 
 
 		 1129 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.15 
 
 		 835 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  26.35 
 
 		 714 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  26.44 
 
 		 807 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  29.1 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  23.11 
 
 		 792 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  26.38 
 
 		 900 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.78 
 
 		 1919 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  27.73 
 
 		 1178 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.34 
 
 		 706 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  24.19 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  23.79 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  24.74 
 
 		 1848 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.71 
 
 		 818 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.81 
 
 		 837 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  25.58 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  24.47 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.65 
 
 		 555 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  26.82 
 
 		 533 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.98 
 
 		 555 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  26.98 
 
 		 717 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>