126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2941 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  69.76 
 
 		 515 aa  750    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  71.97 
 
 		 507 aa  782    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  100 
 
 		 511 aa  1065    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  95.69 
 
 		 510 aa  1020    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  66.6 
 
 		 507 aa  730    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  52.8 
 
 		 508 aa  538  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  53.2 
 
 		 507 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  53.07 
 
 		 507 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  51.59 
 
 		 508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  50.79 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  51.6 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  43.95 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  41.9 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  41.7 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  41.9 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  41.45 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  40.38 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  38.63 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  37.8 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  42.03 
 
 		 514 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  41.25 
 
 		 524 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  37.52 
 
 		 524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  36.95 
 
 		 537 aa  356  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  40.43 
 
 		 513 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  39.24 
 
 		 532 aa  353  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  35.48 
 
 		 517 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  39.81 
 
 		 524 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  39.13 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  36.58 
 
 		 525 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  37.12 
 
 		 522 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  36.42 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  38.78 
 
 		 527 aa  334  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  36.9 
 
 		 522 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  38.43 
 
 		 518 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  36.16 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  37.35 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  34.81 
 
 		 528 aa  329  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  36.04 
 
 		 543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  36.13 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  36.6 
 
 		 543 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  36.74 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  34.31 
 
 		 520 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.83 
 
 		 529 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.6 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.41 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.78 
 
 		 501 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 508 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.65 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.85 
 
 		 538 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.04 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.63 
 
 		 538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.63 
 
 		 538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.2 
 
 		 538 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  36.87 
 
 		 501 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.48 
 
 		 538 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.8 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  33.72 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  36.67 
 
 		 501 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  36.05 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.74 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.61 
 
 		 499 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 517 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 537 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  35.7 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  33.78 
 
 		 496 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  33.19 
 
 		 523 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  34.13 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  35.04 
 
 		 501 aa  220  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  35.37 
 
 		 503 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  34.26 
 
 		 505 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 510 aa  219  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.14 
 
 		 495 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  34.84 
 
 		 504 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  34.44 
 
 		 740 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.36 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  34.93 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  34.93 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  35.15 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  31.24 
 
 		 496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  33.56 
 
 		 504 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  35.02 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.68 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  31.5 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  34.55 
 
 		 502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  33.11 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.6 
 
 		 509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  32.56 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  32.56 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  33.05 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>