136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3546 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  243  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  76.72 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  75 
 
 		 120 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  67.86 
 
 		 115 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  64.91 
 
 		 119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  65.18 
 
 		 115 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  66.67 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  55.75 
 
 		 113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  76.92 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  51.4 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  33.94 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  41.57 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  33.64 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.03 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  43.06 
 
 		 289 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  32.53 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  29.41 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  32.1 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.81 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  29.81 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  36.99 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  29.49 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  26.14 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  29.17 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  26.14 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  28.87 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  31.65 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  27.72 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  30.85 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  27.17 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  35.71 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  26.53 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  27.72 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  31.17 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  32.95 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  27 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  32.95 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  28.92 
 
 		 282 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  31.33 
 
 		 280 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  28 
 
 		 326 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  29.79 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  29.76 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  30 
 
 		 329 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  29.81 
 
 		 280 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.34 
 
 		 287 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 331 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  26.8 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  31.34 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  29.27 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  26.04 
 
 		 144 aa  43.9  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  31.76 
 
 		 269 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  30 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  32.43 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  31.33 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  31.82 
 
 		 285 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  26.09 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  27.4 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  32.5 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  35.48 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  29.27 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  26.25 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  32.94 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  25.45 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2808  predicted protein  31.58 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  30.14 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  36.62 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  32.93 
 
 		 460 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  30.12 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  29.73 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  32.1 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  30.12 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  30.12 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  29.49 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  28.79 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  24.74 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.96 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  28.57 
 
 		 104 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  28.77 
 
 		 119 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  22.68 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 140 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 140 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 140 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  35.62 
 
 		 138 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  27.06 
 
 		 113 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  30.12 
 
 		 282 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  28.74 
 
 		 169 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  27.66 
 
 		 287 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.58 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  32.35 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  30.12 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.44 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  32.35 
 
 		 277 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  28.09 
 
 		 700 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  24.76 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0306  thioredoxin  28.4 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00417001  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  33.33 
 
 		 547 aa  40.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  32.5 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  24.75 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>