194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2669 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2914  penicillin amidase  56.76 
 
 		 770 aa  892    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3220  penicillin amidase  58.51 
 
 		 768 aa  948    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  60.8 
 
 		 769 aa  978    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.272902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3540  penicillin amidase  51.73 
 
 		 768 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2669  penicillin amidase  100 
 
 		 782 aa  1601    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02441  putative hydrolase  47.97 
 
 		 776 aa  729    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1223  penicillin amidase family protein  37.31 
 
 		 810 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0780  peptidase  38.39 
 
 		 796 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0792  putative penicillin amidase  38.49 
 
 		 796 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  38.54 
 
 		 886 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0961  penicillin amidase  37.76 
 
 		 804 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1282  peptidase S45 penicillin amidase  37.84 
 
 		 775 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224327  normal  0.39054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  37.85 
 
 		 831 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1765  peptidase S45 penicillin amidase  37.7 
 
 		 777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0831  penicillin amidase  36.87 
 
 		 829 aa  454  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0438978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  37.4 
 
 		 797 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01150  penicillin acylase II  37.89 
 
 		 805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1038  penicillin amidase, putative  35.91 
 
 		 783 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2163  peptidase  36 
 
 		 815 aa  439  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.703029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1484  putative penicillin amidase  35.88 
 
 		 790 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0153  putative penicillin amidase  35.88 
 
 		 790 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1011  putative penicillin amidase  35.88 
 
 		 790 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2008  putative penicillin amidase  35.75 
 
 		 790 aa  436  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2028  putative penicillin amidase  36.21 
 
 		 790 aa  436  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3735  penicillin amidase  35.02 
 
 		 758 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  32.87 
 
 		 786 aa  365  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.67 
 
 		 796 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  26.55 
 
 		 796 aa  248  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  26.99 
 
 		 796 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.48 
 
 		 796 aa  245  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.48 
 
 		 796 aa  245  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.8 
 
 		 796 aa  244  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.48 
 
 		 796 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.61 
 
 		 796 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  26.95 
 
 		 822 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  26.11 
 
 		 796 aa  241  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.99 
 
 		 796 aa  241  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  28.14 
 
 		 804 aa  218  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  27.41 
 
 		 819 aa  211  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  26.3 
 
 		 774 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  27.01 
 
 		 779 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  27.31 
 
 		 827 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.57 
 
 		 813 aa  201  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  26.68 
 
 		 855 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  26.15 
 
 		 783 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 		 833 aa  198  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  28.45 
 
 		 817 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  26.19 
 
 		 821 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.43 
 
 		 810 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  26.15 
 
 		 870 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  27 
 
 		 803 aa  194  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  26.89 
 
 		 823 aa  193  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.42 
 
 		 857 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.37 
 
 		 818 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.33 
 
 		 854 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  27 
 
 		 854 aa  188  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  25.78 
 
 		 770 aa  187  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.45 
 
 		 819 aa  187  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  26.61 
 
 		 843 aa  187  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  28.22 
 
 		 769 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.61 
 
 		 827 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.35 
 
 		 872 aa  184  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  27.46 
 
 		 821 aa  183  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.34 
 
 		 858 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  26.81 
 
 		 829 aa  183  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1846  penicillin amidase  26.3 
 
 		 698 aa  183  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275998 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  27.69 
 
 		 789 aa  181  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  27.1 
 
 		 856 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4913  peptidase S45 penicillin amidase  26.83 
 
 		 740 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0991334  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  25.36 
 
 		 823 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  29.05 
 
 		 821 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.52 
 
 		 780 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.25 
 
 		 818 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1588  penicillin amidase  28.18 
 
 		 693 aa  172  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0427638 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  25.12 
 
 		 823 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  25.46 
 
 		 903 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  25.9 
 
 		 807 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  25.61 
 
 		 810 aa  169  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.51 
 
 		 809 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  26.81 
 
 		 792 aa  168  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  25.79 
 
 		 808 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.41 
 
 		 864 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  25.96 
 
 		 889 aa  167  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  25.77 
 
 		 809 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  25.49 
 
 		 821 aa  161  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  24.58 
 
 		 827 aa  160  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  25.71 
 
 		 847 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  25.12 
 
 		 788 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  25.25 
 
 		 788 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  25.34 
 
 		 787 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  25.13 
 
 		 837 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2114  penicillin acylase-like protein  25.6 
 
 		 774 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  25.13 
 
 		 837 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.4 
 
 		 906 aa  155  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  25 
 
 		 837 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  24.87 
 
 		 837 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  24.87 
 
 		 837 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  24.87 
 
 		 837 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  24.87 
 
 		 823 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  26.01 
 
 		 847 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>