More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  100 
 
 		 306 aa  623  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  46.44 
 
 		 308 aa  271  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  44.33 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  43.94 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.68 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  41.06 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.79 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  41.38 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  41 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  37.62 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  35.91 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  42.73 
 
 		 379 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  36.73 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  38.06 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.35 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.08 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.84 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  37.45 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  35.04 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 366 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.84 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  33.56 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  39.18 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  37.11 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.58 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  35.56 
 
 		 358 aa  155  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  35.13 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  34.25 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  34.94 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  35.99 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  36.33 
 
 		 349 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  34.21 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  33.97 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  33.2 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  31.69 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  32.22 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.46 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.84 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.25 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.33 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  35.63 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  32.2 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.8 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.5 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.17 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  30.82 
 
 		 361 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  32.3 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.17 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  34.07 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.78 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.12 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1971  ApbE family lipoprotein  25.94 
 
 		 392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.13 
 
 		 367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.5 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.77 
 
 		 350 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.77 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  29.44 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  36.75 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.77 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.77 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.77 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  29.67 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  31.48 
 
 		 335 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  34.04 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  31.29 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.27 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  29.49 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  30.49 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  30.59 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  31.75 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.15 
 
 		 343 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  32.44 
 
 		 370 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  32.81 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  32.69 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  36 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  34.8 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  26.33 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  32.44 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  32.3 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.59 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  33.19 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  32 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  33.92 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.37 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.07 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>