85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03430 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03430  transposase  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  97.67 
 
 
368 aa  511  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  97.67 
 
 
368 aa  511  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.96 
 
 
374 aa  311  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.92 
 
 
361 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.24 
 
 
363 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  40.24 
 
 
363 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  33.73 
 
 
332 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.98 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.98 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.98 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.98 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.59 
 
 
369 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  31.89 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
369 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 
369 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  36 
 
 
403 aa  111  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  36 
 
 
371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.09 
 
 
373 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  32.28 
 
 
391 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  32.28 
 
 
391 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  32.28 
 
 
391 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  32.28 
 
 
391 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  32.28 
 
 
391 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  32.28 
 
 
391 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  32.28 
 
 
391 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  32.28 
 
 
391 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  32.28 
 
 
391 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  32.28 
 
 
391 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  32.28 
 
 
391 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.81 
 
 
366 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  31.89 
 
 
391 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.16 
 
 
372 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
376 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.5 
 
 
370 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
376 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.5 
 
 
370 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.5 
 
 
370 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.99 
 
 
376 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  31.16 
 
 
384 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.5 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  30.35 
 
 
384 aa  92  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.5 
 
 
159 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  33.67 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  30.63 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  32.53 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  28.24 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  26.95 
 
 
348 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  26.95 
 
 
346 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.95 
 
 
374 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  30.77 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.21 
 
 
342 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.21 
 
 
342 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  33.33 
 
 
382 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.09 
 
 
343 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  26.09 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  26.09 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  26.28 
 
 
355 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  27.72 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.51 
 
 
134 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.33 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  25.18 
 
 
355 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.95 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.95 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.98 
 
 
408 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.98 
 
 
408 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.11 
 
 
539 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  25.95 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.98 
 
 
411 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9214  transposase for insertion sequence  32.64 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.35 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.85 
 
 
406 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.85 
 
 
406 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.85 
 
 
406 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
378 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.79 
 
 
406 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.16 
 
 
343 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.16 
 
 
343 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>