More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3272 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  41.08 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  37.07 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  38.31 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  38.31 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  42.7 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  39.3 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.61 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.41 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.24 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 295 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  41.75 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.89 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  28.29 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  34.41 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.85 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  34.71 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.53 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  38.26 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.37 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  34.23 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  26.97 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 1012 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.43 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.88 
 
 		 289 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 274 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.88 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.88 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  29.31 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.21 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  29.65 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  34.29 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  35.85 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  33.01 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.28 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.49 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  37.86 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>